目前疾病管制署合約之旅遊醫學門診共有30間：
1.基隆市：衛生福利部基隆醫院
2.臺北市：財團法人馬偕紀念醫院台北分區、三軍總醫院內湖院區、臺灣大學醫學院附設醫院、臺北市立萬芳醫院
3.新北市：亞東紀念醫院、臺北慈濟醫院
4.桃園縣：衛生福利部桃園醫院、壢新醫院桃園國際機場醫療中心
5.新竹市：臺大醫院新竹分院、東元綜合醫院
6.苗栗縣：衛生福利部苗栗醫院
7.台中市：衛生福利部臺中醫院、童綜合醫院梧棲院區
8.彰化縣：彰化基督教醫院
9.南投縣：埔里基督教醫院
10.雲林縣：臺大醫院雲林分院
11嘉義縣：嘉義長庚紀念醫院、天主教聖馬爾定醫院
12.台南市：成功大學醫學院附設醫院
13.高雄市：高雄市立小港醫院、高雄市立聯合醫院
14.屏東縣：屏東基督教醫院
15.臺東縣：衛生福利部臺東醫院
16.花蓮縣：衛生福利部花蓮醫院
17.宜蘭縣：羅東聖母醫院
18.澎湖縣：三軍總醫院澎湖分院
19.金門縣：衛生福利部金門醫院
20.連江縣：福建省連江縣立醫院
權責單位：衛生局 科別：疾管科
連絡人：蔡先生 連絡方式：082-330697#616